Rufus Ishimoto był japońskim katolikiem, członkiem Bractwa Różańcowego. W okresie prześladowań chrześcijan w Japonii, 17 sierpnia 1621 roku, został aresztowany w domu Pawła Tanaka wraz z innymi osobami, w tym misjonarzem Józefem Negro Maroto. Został ścięty 10 września 1622 roku na wzgórzu Nishizaka w Nagasaki z powodu wiary. Tego samego dnia stracono tam również wielu innych chrześcijan. Rufus Ishimoto został beatyfikowany 7 lipca 1867 roku przez papieża Piusa IX w grupie 205 męczenników japońskich. Jego wspomnienie obchodzone jest 10 września.