Jan Nektariusz urodził się jako Jewgraf Kowalewski 13 lub 26 marca 1905 roku w Petersburgu. Był synem Jewgrafa Kowalewskiego, rosyjskiego działacza państwowego i cerkiewnego, oraz Inny z domu Striekałowej. W wieku piętnastu lat, wraz z rodziną, wyemigrował do Francji, początkowo osiedlając się w Nicei, a następnie w Paryżu. W stolicy Francji ukończył studia na Sorbonie na wydziale filologicznym, a następnie kształcił się w prawosławnym Instytucie św. Sergiusza. Zmarł 30 stycznia 1970 roku w Paryżu.