Jan Naisen urodził się w bardzo religijnej rodzinie w XVII wieku w Japonii. Był mężem błogosławionej Moniki Naisen, a ich synem był błogosławiony Ludwik Naisen. Podczas nasilonych prześladowań katolików w kraju, wraz z żoną udzielił schronienia błogosławionemu księdzu Janowi Chrzcicielowi Zoli. Niedługo potem małżonkowie zostali aresztowani za swoją działalność. Zmarł w 1626 roku w Nagasaki, ponosząc śmierć męczeńską za wiarę.