Jan III Scholastyk urodził się około 503 roku, najprawdopodobniej w miejscowości Sirimis. W 565 roku został wybrany na 32. patriarchę Konstantynopola, sprawując ten urząd aż do swojej śmierci w 577 roku. Jego pontyfikat przypadł na okres późnego antyku, kiedy to Kościół chrześcijański przeżywał liczne przemiany teologiczne i organizacyjne. Za jego rządów kontynuowano prace nad ujednoliceniem doktryny oraz umacnianiem struktur kościelnych w Cesarstwie Bizantyńskim. Jan III Scholastyk jest czczony jako święty w Kościele prawosławnym, a jego wspomnienie liturgiczne obchodzone jest 31 sierpnia. Brak jest szczegółowych informacji na temat jego życia prywatnego lub działalności poza funkcją patriarchy.