Benedykt II urodził się w Rzymie, jednak dokładna data jego narodzin nie jest znana. Przed objęciem urzędu papieskiego był cenionym prezbiterem, wyróżniającym się wiedzą biblijną. Na papieża został wybrany 26 czerwca 684 roku. Jego pontyfikat trwał krótko, gdyż zmarł 8 maja 685 roku. Zachowały się nieliczne informacje na temat jego działalności jako papieża, co wynika z ograniczonych źródeł historycznych dotyczących tego okresu.