Agapit I urodził się w Rzymie przed rokiem 494 i pochodził z rodziny związanej z Kościołem – jego ojciec Gordianus był kapłanem rzymskim. Na Stolicę Piotrową został wybrany 13 maja 535 roku i sprawował urząd do swojej śmierci 22 kwietnia 536 roku. W 536 roku podjął podróż do Konstantynopola na zaproszenie króla Ostrogotów Teodata, starając się bezskutecznie powstrzymać cesarza bizantyjskiego Justyniana I przed inwazją na Królestwo Ostrogotów. Podczas pobytu w Konstantynopolu Agapit I zdjął z urzędu patriarchę Anthimego I i osobiście konsekrował jego następcę, Menasa. Zachowały się cztery listy papieża z tego okresu, w tym skierowane do Justyniana oraz biskupów Afryki i Kartaginy. W tradycji katolickiej jego wspomnienie obchodzone jest 20 września, natomiast w prawosławiu – 22 kwietnia.